除上述注意事項外，企業(yè)還需要注意以下幾類特殊事項的處理：
一是可以稅前扣除的資產(chǎn)損失應該是實際處置后產(chǎn)生的損失，對于企業(yè)未實際處置的減值準備所發(fā)生的損失在財務上可以作為利潤的減除項，但在企業(yè)所得稅前不能扣除。
二是權益法下計算的股權投資損失不能在稅前扣除，根據(jù)《企業(yè)資產(chǎn)損失稅前扣除管理辦法》規(guī)定，可以在稅前扣除的應為確實無法收回的投資，需要滿足該辦法第三十四條相關條件方可在稅前扣除。如果是投資年度因權益法所計算出來的投資損益不能在稅前扣除。
三是根據(jù)《企業(yè)資產(chǎn)損失稅前扣除管理辦法》規(guī)定，企業(yè)對于不能確定是否屬于自行計算扣除類的損失，應及時向稅務機關提出申請，避免因自行判斷失誤而錯失申請時間，導致不能及時扣除的風險。
四是發(fā)生資產(chǎn)損失時應先沖減以前年度準備金余額。國家稅務總局《關于企業(yè)所得稅執(zhí)行中若干稅務處理問題的通知》（國稅函[2009]202號）第二條規(guī)定，在2008年度以后經(jīng)稅務機關批準的壞賬損失應先沖減以前年度壞賬準備金余額后再在企業(yè)當年進行扣除。
五是財政部、國家稅務總局《關于金融企業(yè)貸款損失準備金企業(yè)所得稅稅前扣除有關問題的通知》（財稅[2009]64號）規(guī)定，金融企業(yè)發(fā)生的符合條件的貸款損失，按規(guī)定報經(jīng)稅務機關審批后，應先沖減已在稅前扣除的貸款損失準備，不足沖減部分可據(jù)實在計算當年應納稅所得額時扣除。
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